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실시간 유전자 분석 시스템
- 제조회사
- Bio-rad
- 도입연도
- 2016
- 부서/문의처
- 의과대학 / 053-580-3884
- 용도
- 1) 96개의 샘플 튜브는 3개의 발광 다이오드(filterd LED)에 의해 형광 신호를 얻을 수 있도록 여기(excitation) 되며 450~580nm 형광 파장을 제공2) 2개의 형광 물질을 하나의 반응 튜브에서 동시에 분석할 수 있으며 (2-target multiplex), 여분의 1개 분석 채널을 이용하면 FRET 실험도 가능3) 8단계에 걸쳐 온도 구배(Thermal gradient) 조건을 사용할 수 있기 때문에, 최적의 실험 조건을 설정하는 경우 매우 유용하게 사용할 수 있으며, 서로 다른 실험 조건의 실험을 한 번의 PCR 반응만을 통해서도 수행 가능4) 96개의 샘플 튜브는 독립적으로 여기 및 검출되기 때문에 각 샘플에서 얻어지는 형광신호의 간섭(cross-talk)이 최소화 됩니다. 또한 3개의 LED는 그 수명이 반영구적이어서 별도의 교체 비용이나 유지비용이 추가되지 않음.5) 컴퓨터에 연결하여 정량 분석 실험이 가능하며 시료가 있는 현장으로 이동해서도 실험을 진행할 수 있으며, 실험 도중에 전원이 차단되더라도 전원이 재개되는 순간 실험이 복구되어 남은 실험 과정을 지속할 수 있으며, 또한 PC와의 연결이 끊기거나 통신 상태가 종료되더라도 기기 자체에 저장된 데이터를 이용하여 실험 결과를 확인가능6) 고해상도 멜팅 분석(High-resolution melt analysis, HRM)이 가능하여 유전자 내의 염기서열 변화를 검출가능7) 기본 온도 조절 블록인 thermal cycler는 정확한 온도 조절 기능과 온도 구배 기능을 가능하게 해 주며, 6개의 독립적으로 조절되는 TE모듈(Thermal electric module)을 통해 반응 블록 내의 온도 균일성은 ±0.4℃로 유지되며, 시료에 전달되는 온도의 정확성은 ±0.2℃가 됨.8) 사용자가 이용하는 중합효소 및 프라이머의 특징과 반응 산물의 길이에 따라 실험 조건을 자동으로 설정할 수 있는 자동 프로토콜 설정 기능이 내장되어 있어 손쉽게 실험 조건을 설정 가능9) 사용이 쉽고 다양한 기능의 소프트웨어는 편리한 실험 조건 설정과 정확한 데이터 분석을 빠르게 할 수 있도록 해 줍니다. 특히, 광학 검출기(optic detector)는 모든 위치에서 데이터 값을 자동으로 읽어 들이기 때문에 시료의 위치를 잘못 설정하더라도, 실험이 진행되는 도중이나 실험이 종료된 이후에 언제라도 시료의 정보를 수시로 편집 가능10) 상대정량 분석을 진행하는 경우, 통계 분석을 객관적으로 표준화 할 수 있도록 여러 개의 기준 유전자(reference gene)를 이용하여 동시에 분석할 수 있습니다. 또한, 최대 5,000-well의 데이터를 분석 소프트웨어 내에서 하나의 파일로 합하여 분석이 가능하기 때문에 실험 시료의 수적 제약을 최소화할 수 있음
- 주요사양 및 특징
- 1) CFX connect 반응 블록 및 96 well 광학 검출기 (1) Thermal 반응 블록 (가) 최대 온도 변화 속도: 5℃/초 (나) 평균 온도 변화 속도: 3.3℃/초 (다) 가열/냉각 방식: 펠티어소자 (라) 상부가열 온도: 105℃ 까지 (마) 온도 범위: 0-100℃ 정확도: ±0.2℃ 균일도: ±0.4℃ (바) 온도구배가능 여부: 가능 범위: 30-100℃ 구배범위: 1-24℃ (2) 광학검출기 (가) 광원: 3 filtered LEDs(나) 광학검출기: 3 filtered photodiodes(다) 여기 및 검출범위: 450-580nm(라) 감도: 1copy 유전자까지 검출 가능(마) 멀티플랙스: 1개 tube에서 2개 유전자 동시 검출(바) 검출범위: 10 orders of magnitude (3) 시스템(가) PCR 먼허보유: 가능(나) 전기인증: IEC, CE(다) 샘플블럭: 96 well(라) 샘플 사이즈: 1~50ul (10-25ul recommend)(마) 크기(W×D×H): 33cm×46cm×36cm(바) 무게: 21kg (사) USB 주변 장치와의 호환: USB 2.0 2) CFX Manager 소프트웨어 (1) Operating Systems: Windows XP Professional, Windows Vista Professional, Windows 7 (2) 자료 분석 (가) 표준 검량선(standard curve)을 이용한 PCR 정량 (나) 온도별 Melt curve 분석 및 상대정량 분석(ΔCq)에 의한 유전자 발현 분석 (다) 다수의 기준 유전자(reference gene) 및 반응 효율을 이용하여 직접 분석할 수 있는 표준화 발현 분석 (ΔΔCq) (라) 여러 개의 결과 파일(최대 5,000-well)을 하나로 묶어 분석할 수 있기 때문에 샘플 분석의 제약이 없음. (마) 대립인자 분석(SNP genotyping) 및 End-point 분석이 가능 (바) 정확한 데이터 분석 및 통계 분석 기능 (사) 온도 구배(thermal gradient) 기능으로 다양한 조건의 실험을 동시에 수행 가능 (아) 유전자 발현량에 대한 정량 분석 결과를 그래프 및 통계 수치로 표현 (자) 그래픽 처리된 프로토콜 표현 및 메뉴 설정 방식의 프로토콜 편집 기능(3) 자료 변환 (가) 손쉽게 마우스를 이용하여 모든 그래프와 스프레드시트를 저장, 복사, 인쇄하는 것이 가능함. (나) 마이크로소프트사의 엑셀 프로그램으로 직접 변환이 가능 (다) 그래프와 자료 등을 마이크로소프트사의 엑셀, 워드, 파워포인트 파일로 직접 복사 및 붙여넣기가 가능 (라) 사용자가 원하는 보고서 형태에 프로토콜, 결과 그래프, 스프레드시트 등을 포함시킬 수 있으며, PDF 파일 형태로 저장 및 출력이 가능
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